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行業(yè)動(dòng)態(tài)

各種裂解液中的破膜組分的功能

作者: 小布丁大更新時(shí)間:2024-07-26

各種裂解液中的破膜組分主要用于細(xì)胞裂解,以便釋放細(xì)胞內(nèi)部的蛋白質(zhì)、核酸和其他生物分子。細(xì)胞裂解液的主要目的:1.利用去污劑破壞脂質(zhì)雙分子層,破裂細(xì)胞;2. 溶解蛋白;3. 蛋白變性使其穩(wěn)定;4. 抑制蛋白酶活性 

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關(guān)于去垢劑 (detergents):

幾種組織/細(xì)胞裂解液裂解強(qiáng)度(應(yīng)用)的差異主要還是配方中去污劑種類和濃度的不同。去污劑分為變性去污劑(denaturing detergents)非變性去污劑(non-denaturing detergents),前者可以是陰離子,比如SDS;或陽離子,比如乙基三甲基溴化銨。這些去垢劑總體來說破壞膜和通過打破蛋白-蛋白間相互作用來變性蛋自;非變性去垢劑分為非離子,比如Titon X-100;膽鹽,比如膽酸鹽類;和兩性離子去垢劑,比如CHAPS。

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不同類型的裂解液和其破膜組分具有不同的功能和特點(diǎn):


1. 非離子型和兩性離子型去污劑(如Triton X-100, Tween 20, NP-40)
? 破壞細(xì)胞膜的脂質(zhì)雙層,但通常不會(huì)破壞細(xì)胞器膜。
? 保留蛋白質(zhì)的天然構(gòu)象,適合用于需要保留蛋白質(zhì)活性的實(shí)驗(yàn),如免疫沉淀和酶活性測定。


例如,在免疫沉淀或ELISA實(shí)驗(yàn)中,Tween 20常用于洗脫非特異性結(jié)合的蛋白質(zhì),以減少背景信號(hào),提高實(shí)驗(yàn)的特異性和靈敏度。在蛋白質(zhì)提取和純化過程中,可以防止蛋白質(zhì)的非特異性吸附和變性,幫助保持蛋白質(zhì)的穩(wěn)定性。CHAPS常用于保持蛋白質(zhì)活性和結(jié)構(gòu)的同時(shí)破裂膜結(jié)構(gòu),適用于功能分析。Digitonin作為一種溫和的去污劑,可以選擇性地溶解包含膽固醇的膜,如細(xì)胞膜和線粒體外膜,但對(duì)線粒體內(nèi)膜影響較小。這使得它特別適合用于區(qū)分和分離線粒體外膜和內(nèi)膜。常用于選擇性地提取線粒體外膜,同時(shí)保持內(nèi)膜的完整性。相比于其他去污劑,Digitonin的作用較為溫和,能夠在保持蛋白質(zhì)活性的同時(shí)提取膜蛋白,這對(duì)于需要保留蛋白質(zhì)功能的實(shí)驗(yàn)非常重要。NP-40是很溫和的去垢劑,1%濃度的基本可以破壞掉胞膜,而對(duì)核膜破壞的作用弱,結(jié)合特定的buffer可以獲得胞漿蛋白。 

TritonX-100的能力介于NP40和SDS之間,偏向于NP40,溶解脂質(zhì),增加細(xì)胞膜的通透性,也是常用的細(xì)胞裂解液成分之一,在保護(hù)蛋白活性方面有一定作用(SDS基本會(huì)使蛋白變性失活)。但是去垢劑屬性只是一方面,buffer、配比、濃度、提取方法和材料處理也都是關(guān)鍵因素。


2. 陰離子型去污劑(如SDS, Deoxycholate):

? 能有效溶解細(xì)胞膜及蛋白質(zhì),常用于徹底裂解細(xì)胞,提取總蛋白質(zhì)。
? 會(huì)使蛋白質(zhì)變性,適合用于SDS-PAGE和Western Blot等實(shí)驗(yàn)。

例如,去氧膽酸鈉能有效地破壞細(xì)胞膜和核膜,廣泛用于總蛋白質(zhì)提取。在裂解細(xì)胞和組織時(shí),它能夠幫助溶解細(xì)胞膜中的脂質(zhì)成分,釋放細(xì)胞內(nèi)容物。因此,常用于溶解和提取膜蛋白。相比于非離子型去污劑,它能夠更加徹底地溶解難以提取的膜蛋白。

SDS屬于離子型去垢劑,最厲害,基本可以把細(xì)胞完全破掉,DNA會(huì)釋放出來,裂解液變得很粘稠。 

去氧膽酸鈉有時(shí)與其他去污劑(如SDS)聯(lián)合使用,以增強(qiáng)去污和蛋白質(zhì)溶解效果。在某些情況下,與非離子型去污劑(如Triton X-100)聯(lián)合使用,可以兼顧蛋白質(zhì)溶解和活性保持。


常見的細(xì)胞裂解液成分:

50mM Tris-HCl pH7.4        (緩沖體系)

150mM NaCl                     (等滲體系)

1mM PMSF                        (蛋白酶抑制劑)

1mM EDTA                         (變性劑和穩(wěn)定劑)

5μg/ml Aprotinin                (蛋白酶抑制劑)

5μg/ml Leupeptin               (蛋白酶抑制劑)

1% Triton X-100                 (弱變性劑)

0.1% SDS                           (強(qiáng)變性劑和溶解劑)

1% Sodium deoxycholate   (中度變性劑和溶解劑)


一些常用裂解液的主要特點(diǎn)和差異:

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  • 用于普通的Western、IP或co-IP,通常使用Western及IP細(xì)胞裂解液。裂解細(xì)胞或組織后,沒有非常粘滯的透明狀DNA團(tuán)塊形成,不必采用超聲處理等就可以非常理想地用于后續(xù)操作。另外該裂解液裂解的產(chǎn)物也適合用于磷酸化蛋白的Western檢測。

  • 對(duì)于某些特殊蛋白的IP,如果發(fā)現(xiàn)Western及IP細(xì)胞裂解液)效果不是非常理想,可以嘗試用RIPA裂解液(強(qiáng)、中或弱)或NP-40裂解液。如果發(fā)現(xiàn)IP的時(shí)候背景很高,即非特異的蛋白也被IP下來,則需要選用裂解強(qiáng)度較高的裂解液,例如RIPA裂解液(強(qiáng)或中)。如果發(fā)現(xiàn)目的蛋白無法被IP下來,則說明裂解液的強(qiáng)度過強(qiáng),可以使用較為溫和的裂解液例如RIPA裂解液(弱)或NP-40裂解液。

  • 對(duì)于某些難溶解蛋白的Western,如果發(fā)現(xiàn)Western及IP細(xì)胞裂解液效果不是非常理想,可以嘗試使用裂解強(qiáng)度更高的裂解液例如RIPA裂解液(強(qiáng)、中)或SDS裂解液。

  • 用于特定用途需要自行添加特定抑制劑或不需要添加抑制劑時(shí),可以考慮最后兩種。用Western及IP細(xì)胞裂解液(無抑制劑)在很多時(shí)候可以兼容酶活性和生物小分子的檢測,對(duì)于特定的酶或生物小分子的檢測是否兼容需要自行測試。Western及IP細(xì)胞裂解液(無抑制劑)的裂解能力比RIPA裂解液(強(qiáng),無抑制劑)弱一些,但用于酶活性和生物小分子時(shí),兼容性通常會(huì)更好一些。

蛋白酶抑制劑:抑制蛋白酶的活性,避免蛋白過度降解。

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磷酸酶抑制劑:抑制去磷酸化作用

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3. 裂解酶(如Lysozyme, Trypsin):
? 針對(duì)特定類型的細(xì)胞,如細(xì)菌細(xì)胞,能夠降解細(xì)胞壁成分,使細(xì)胞膜易于裂解。
? 常與其他裂解劑聯(lián)合使用,增強(qiáng)裂解效果。

4. 機(jī)械破碎法(如超聲波裂解、玻璃珠研磨):
? 不依賴化學(xué)裂解液,適用于堅(jiān)硬的細(xì)胞壁(如酵母和植物細(xì)胞)。
? 可通過控制處理強(qiáng)度和時(shí)間調(diào)節(jié)裂解效果。

5. 高滲或低滲裂解(如低鹽緩沖液):
? 利用滲透壓差導(dǎo)致細(xì)胞脹裂或收縮破裂,適合裂解脆弱的細(xì)胞類型。
? 通常配合其他裂解方法使用,以提高效率。

6. 有機(jī)溶劑(如乙醇、乙酸乙酯):
? 能溶解脂質(zhì)膜,但可能對(duì)蛋白質(zhì)有較大破壞作用。
? 適用于某些特定實(shí)驗(yàn),如脂質(zhì)分析。

選擇合適的裂解液及其破膜組分,取決于具體的實(shí)驗(yàn)?zāi)康暮图?xì)胞類型。確保實(shí)驗(yàn)條件不會(huì)破壞目標(biāo)分子的活性或結(jié)構(gòu),是進(jìn)行成功實(shí)驗(yàn)的關(guān)鍵。



1.細(xì)胞裂解液影響細(xì)胞膜和核膜的破壞效率, 所以應(yīng)根據(jù)目標(biāo)分子在細(xì)胞內(nèi)的定位選擇裂解液。此外,不同的細(xì)胞和組織具有不同的膜組成和結(jié)構(gòu),需要針對(duì)其特性選擇特定裂解液。使用錯(cuò)誤的細(xì)胞裂解液可能導(dǎo)致細(xì)胞裂解不完全,進(jìn)而影響數(shù)據(jù)的準(zhǔn)確性。

2.適當(dāng)?shù)牧呀庖簩?duì)于維持細(xì)胞內(nèi)目標(biāo)分子的穩(wěn)定性和完整性至關(guān)重要。例如,在核酸研究中,裂解液會(huì)影響RNA、DNA及其修飾的完整性。在蛋白質(zhì)組學(xué)中,它影響蛋白質(zhì)和翻譯后修飾的穩(wěn)定性。使用錯(cuò)誤的緩沖液可能導(dǎo)致這些分子的降解或變性,從而損害下游分析的準(zhǔn)確性。

3.細(xì)胞裂解液對(duì)試驗(yàn)結(jié)果的一致性有重要的影響。不同的緩沖液pH值、離子強(qiáng)度和去垢劑不同,這些因素可能影響酶、蛋白質(zhì)和其他細(xì)胞組分的結(jié)構(gòu)和活性。保持緩沖液一致性對(duì)于確保實(shí)驗(yàn)的可重復(fù)性至關(guān)重要。

4.選擇錯(cuò)誤的裂解液會(huì)造成樣品中無目的蛋白情況,例如目的蛋白為核蛋白時(shí)請(qǐng)勿使用NP40這類溫和的裂解液。

5. 如果是分泌型蛋白,例如細(xì)胞因子或趨化因子等,組織或者細(xì)胞的裂解液可能并不能直接反映目的蛋白的表達(dá)水平,一方面可以通過刺激處理促進(jìn)其胞內(nèi)表達(dá),另一方面可以嘗試ELISA或者Luminex多因子檢測等實(shí)驗(yàn)方法對(duì)細(xì)胞上清液或者生物體液等進(jìn)行檢測。此外,樣本收集及保存過程中,需要考慮目的蛋白降解的風(fēng)險(xiǎn),建議使用新鮮的裂解液對(duì)新鮮收集的樣本進(jìn)行蛋白提取,并確保裂解液中蛋白酶抑制劑及磷酸酶抑制劑活性,防止蛋白降解。樣本盡量低溫保存,并避免反復(fù)凍融。


來源 微信公眾號(hào):“科研這點(diǎn)事兒